Projektgruppe (Leitung: Minou Nowrousian) am Lehrstuhl für Allgemeine und Molekulare Botanik der Ruhr-Universität Bochum.

Die meisten Pilze wachsen in Form von Hyphen, dabei handelt es sich um lange, verzweigte Zellfäden. Diese können zu komplexen Strukturen aggregieren, z.B. zu Fruchtkörpern, in denen Sporen gebildet werden. Wir untersuchen die genetische Basis dieser Differenzierungsprozesse. Zu diesem Zweck analysieren wir Mutanten, die in frühen Stadien der Fruchtkörperentwicklung gehemmt sind, und vergleichen die Genexpression in den Mutanten mit der des Wildtyps mittels Mikroarray-Analysen und quantitativer Real-Time-PCR. Weiterhin vergleichen wir die Genexpression in verschiedenen Pilzen untereinander, um evolutionär konservierte Expressionsmuster zu identifizieren. Gene mit gleicher Regulation in verschiedenen Spezies können dazu genutzt werden, eine zentrale Gruppe von Genen zu definieren, die an der pilzlichen Fruchtkörperbildung beteiligt sind. Weitere Details zu diesen Projekten gibt es auf der Projektseite und in einigen Publikationen.

Neu: Sordaria macrospora-Genom mit Next-Generation-Techniken sequenziert!

Das Genom wurde mittels "Next-Generation"-Techniken (Solexa und 454) sequenziert und assembliert. Weitere Informationen auf der Projektseite. Hier klicken zum Genombrowser und hier zum Download.

Veröffentlichung:

Nowrousian M, Stajich JE, Chu M, Engh I, Espagne E, Halliday K, Kamerewerd J, Kempken F, Knab B, Kuo HC, Osiewacz HD, Pöggeler S, Read ND, Seiler S, Smith KM, Zickler D, Kück U, Freitag M (2010) De novo assembly of a 40 Mb eukaryotic genome from short sequence reads: Sordaria macrospora, a model organism for fungal morphogenesis. PLoS Genet 6(4): e1000891. doi:10.1371/journal.pgen.1000891 Paper at PLoS Genetics pdf

Neuer Review: Next-generation sequencing for eukaryotic microorganisms

Nowrousian M (2010) Next-generation sequencing techniques for eukaryotic microorganisms: sequencing-based solutions to biological problems. Eukaryot Cell 9: 1300-1310 Abstract pdf

Neues Lehrbuch/Sachbuch !