Hallo ABI QSTAR-User und solche, die es werden wollen,

um die mit dem QSTAR von ABI gemessenen Daten auch auswerten zu können,
habe ich eine Importfunktion für Peakardt geschrieben.
Mit der schon vorhanden DTA-Exportfunktion lässt sich nun eine mit der Analyst-Software erstellte Peakliste
konvertieren, so dass damit eine Sequest-Suche durchgeführt werden kann.

Kurzanleitung:

  1. Im Analyst Peaklisten als Textfile mit der Endung "_qstar" abspeichern.
  2. diese in Peakardt als PFF öffnen und als DTAs in einem neuen Ordner im Sequest-Verzeichnis abspeichern
  3. Sequest mit diesem Verzeichnis starten

Die etwas ausführlichere Anleitung:

  1. Daten mit dem QSTAR akquirieren
  2. in der Analyst-Software das gewünschte Spektrum auswählen
  3. im Spektrum rechte Maustaste drücken und dieses als Textfile abspeichern
    WICHTIG: als Dateiendung "_qstar" eingeben. Automatisch wird zusätzlich die Endung ".txt" angehängt, so dass der Dateiname die Form "NAME_qstar.txt" haben sollte. Als NAME sollte man hier als ersten Buchstaben sein Vornamen Initial und als Rest den Nachnamen gefolgt von einer fortlaufenden, eindeutigen Nummer wählen.
  4. die Punkte 1 bis 4 solange wiederholen, bis gewünschte Anzahl von Spektren erreicht ist
  5. Peakardt im Webbrowser aufrufen (am QSTAR-Rechner in Mozilla direkt in der Adressleiste "Peakardt" anklicken oder Adresse www.peakardt.org eingeben)
  6. Peakardt durch Klick auf den Button "Start Peakardt" starten.
  7. Im Menue "File | Open PFF" anklicken
  8. Die zuvor gespeicherte(n) Datei(en) auswählen und "Öffnen" anklicken
  9. für jede "_qstar"-Datei muss Parentmass und Chargestate in die sich öffnenden Dialogfenster eingegeben werden.
  10. Im Menue "File | Save DTAs" anklicken
  11. Im sich öffnenden File-Dialogfenster in das Verzeichnis "\\N400-2\d\Sequest" wechseln
  12. Dort einen neuen Ordner mit dem gewünschten Namen erstellen (mittleres Symbol rechts oben im Fenster) und "Speichern" anklicken
  13. Sequest im Webbrowser aufrufen (am QSTAR-Rechner in Mozilla direkt in der Adressleiste "Sequest" anklicken oder Adresse http://134.147.84.172/cgi-bin/sequest_launcher.pl eingeben)
  14. das zuvor erstellte Verzeichnis unter "Sequest Directory" selektieren
  15. sonstige Einträge vornehmen
  16. "Run SEQUEST" anklicken


Viel Erfolg,
Kai